电视剧《女医明妃传》中几乎每集都会出现大量中医药方或者食物疗法，这些是否能真正运用在实际生活中引发了观众好奇。不过，电视剧每集开头都有两行字提醒：“本剧中所有中医食疗、医药方剂，为戏剧情景所需，请勿尝试模仿”。南京中医药大学教授、主任中医师潘立群在接受采访时表示，剧中出现的土方因人而异，切勿沉迷于剧情盲目效仿。

《女医明妃传》第一集开始，女主角谭允贤就代言了铁皮石斛，称其为救命“仙草”，并且，用针灸十宣放血法治疗中风急症。作为一部中医题材古装剧，片中几乎每集都有类似中医知识在实际生活中的运用，还不乏民间土方，比如用锅底灰、香灰止血；燕子窝和油治疗脓疮；在监狱中，一位医婆教谭允贤用指甲、鸟粪、蚯蚓混在一起为病人解毒平喘；在药材不足的情况下，谭允贤用鸡粪、地浆水、扁豆混在一起救了霍乱病人。

剧中的这些偏方土法播出后受到了中医专家的质疑。潘立群教授提醒观众：“片中土方子切不可盲目效仿，比如以燕子窝和油治疗恶疮这种方法比较原始，秦汉时期用得比较多，在政治、经济、农业、数学、药学发展已经接近资本主义社会的明代，正常情况下不会出现此类落后无知的治病方法。”

编剧张巍接受采访时表示，“我们的医案都是有出处的，出自明朝以前的一些医学著作。在播出前我们也给浙江的一些医学专家审过，没被提出什么问题。”虽然对剧中的医理有自信，但张巍也表示，不建议大家对着电视剧学习中医：“我个人来说，绝对不推崇在电视剧里寻找一些治病的方子，然后在生活中模仿，我们不肩负在电视剧里给别人治病的责任。我们剧中头三集就有问诊不清闹出人命的情节，那些看了方子就实践都是瞎来，但这并不代表我们的方子是胡编的、不可考的。”比如香灰止血是治疗轻微皮外伤的古代疗法，但现在来模仿就不合适了，小伤口用创可贴已经非常好，既卫生、又方便。

除了讲述女子不得从医的礼教传统以及展现中医知识之外，《女医明妃传》中还出现了神秘的“祝由术”。谭允贤大难不死被一戏班子所救，戏班子中的道士用画符咒语的方式为百姓“治病”，开始，这种“迷信”方法受到谭允贤的质疑，而后，了解到这是已经在太医院失传的“祝由术”后，谭允贤也由衷佩服，并以此为皇太后治病取得奇效。祝由术到底是怎么回事呢？迷信的咒语画符果然符合医理吗？潘立群介绍，“祝由术”可以看作中医中最古老的精神疗法，是真实存在的。咒语是修行人修炼到一定程度时，所发出的特定声音，这些声音，以次声波为多，对人体可以产生共振，共振效果好就可以达到治疗效果。剧中出现的边念咒语边锻炼身体以达到克服身体孱弱的目的，其实是一种原始的心理疗法。

虽然蚯蚓鸡粪治病、牛腹藏人等偏方土法不可取，但是剧中出现的一些中医汤剂、滋补药物很多是流传至今的。比如在治疗大病初愈的病人或者失血过多的病人之后，剧中都会出现比如人参、当归、阿胶等滋补品，这些至今仍然作为养生的重要食物，乌鸡人参汤的补气养元功效、阿胶的补血功效都是可取的。《女医明妃传》掀起的“中医热”有利有弊，中医专家认为观众在尊重历史和弘扬中医的角度上，实事求是，以辨证的目光看待问题，切勿轻易模仿。