三读通过的“国安法”修正案大幅提高对所谓“共谍”的刑罚，为大陆势力发展组织的刑期变为7年以上，成为法律“重罪”。据台湾《中国时报》20日报道，“国安法”原本规定“不得为外国、大陆地区人士刺探、交付、传递秘密文书、图画或者发展组织”，三读修正后处罚明确化，分为“发展组织”“泄露秘密”和“刺探秘密”三个层次，且视犯罪情节分别处罚。它规定，为外国人如美国人、日本人发展组织，刑期为3年以上、10年以下;但是若为大陆地区发展组织，刑期则变为7年以上，最重将被罚1亿元新台币。该报举例称，“新党与陆生共谍周泓旭案”因为周是大陆籍，新党发言人王炳忠等人如获罪，刑期就是以7年起跳。“国安法”修正条文的另一个重点是对“违法”军公教人员采取金钱惩罚制度，他们将丧失退休俸，已支领者则需追缴回“国库”。检察官称，之前台退役少将许乃权被大陆人发展成为“共谍”，被判处2年零10个月有期徒刑，如果依新规定，许已领的退休俸就要被追回。

值得关注的是，“国安法”修正案将“数字空间”纳入台湾安全维护，但未明确主管机关，也没有具体做法，“仍是宣示意味浓厚”。据联合新闻网报道，台“行政院”此前已先后启动两波关于假消息的修法，至于是否启动第三波，有党政人士称，现在没有如此定调，但当局有意修正“数字通讯传播法”，希望与网络平台业者合作，在网络上注记“假消息”。蔡英文20日在脸书称，“调查局”去年侦破52起跟“国安”有关的“共谍”案件，涉案者达174人，代表当局正积极地处理“中国的渗透”，像3月11日召开“国安会议”提出“三道防护网”，迄今100天内，共进行“国家安全法”“国家机密保护法”及“两岸人民关系条例”等修法，“我们不能接受恶意的方式，利用台湾的自由来伤害台湾的自由，我们不会放任不管”。

台湾中国文化大学广告系主任钮则勋分析认为，民进党当局借修订“国安法”打击网络假新闻是幌子，维护政权才是真正目的，而且模糊不清的界定方式更会造成网络上草木皆兵的恐慌。他直言，蔡英文这一系列修法，显示出对自己执政成绩缺乏信心。曾因“国安法”被告的新党发言人王炳忠称，“国安法”规定模糊，给了当局过大的行政裁量空间，“以维护国安名义来打击反对言论”。20日，全台公务人员协会理事长李来希在脸书称，谈权利时要军公教“从低与一般百姓比较”，谈责任时却要从严规范，还要追缴已经消费的所得，“干脆把死人抓出来鞭尸好了”。

对于“共谍罪”的加重，钮则勋认为，此举无疑将挑起两岸敏感神经，但这正是蔡英文的选战主轴，她操弄所谓“维护台湾主权的辣台妹形象”，此次修法将造成两岸更加对立。世新大学资管系副教授吴统雄撰文称，蔡英文当局不仅没有自省，没有任何重振经济建设的务实计划，反而只为动员仇恨投票而打击特定族群，鼓吹战争想象以恐吓人民。国民党政策会前执行长蔡正元20日在脸书称，蔡英文政权假借各种口实，修订“国家机密保护法”“公投法”“国家安全法”和“两岸人民关系条例”，说穿了就是企图建立“台独马其诺防线”：抬高2020年的“台独”竞选声势、巩固3年多建立的“台独”基础、在两岸发展上设立“台独”铁幕、在台湾岛内施展“台独”恐吓力量以及配合美国反中打的“台湾牌”。蔡正元表示，这个防线看似坚固，但还是抵挡不了闪电战术，“重点是2020，谁是闪电战术的总指挥？” 《联合报》20日评论称，这次“国安法”修正，让人看见当局恣意立法扩张权力的可怕。修正案针对“共谍罪”的定义，包括什么叫协助、主持，到什么程度算危害台湾安全，只字未提，不仅造成执行上的困难，也给了当局过大的行政裁量空间。与此同时，“国安法”范围包括网络，但条文却未讲明违法形态和刑责。文章称，众所周知，蔡英文当局当初修法正是为了全面打击“假消息”，而“涉国安问题兹事体大，严谨立法更是基本要求”，执政党称此次是所谓宣示性修法，更凸显其对民众权益的轻视。