一是提升疾控系统治理效能。严格按照改革方案有序推进四级疾控机构改革。尽快调整原卫生部40号令和相关规定，做好国家疾控局与疾控中心等职能划分，强化上级疾控机构对下级疾控机构的业务领导和工作协同，建好上下联动的分工协作机制，突出各级不同的核心职能。尽快出台疾控机构建设新标准。国家、省级疾控机构应建设数量足够、区域均衡的实验室、菌毒种保藏中心，缩小检验检测服务半径。

二是加强专科疾病防治机构建设。尽快补齐四川等19省（市、区）没有省属传染病医院的短板，确保县级医院设置传染病科室。加强专科疾病防治体系建设，构建专科医联体和联盟，在医保政策、收费项目等方面建立价格收费动态调整机制。建立达到同级综合医疗机构待遇平均水平的保障机制，提升岗位吸引力，放宽疾病防治专科医生执业准入条件，加大非专科医生转岗力度。

三是建立稳定的投入机制。持续加大公共卫生投入，疾控机构运转经费增长不低于地方经常性财政支出增长水平。解决部分投入结构不合理、不平衡问题，提高财政资金使用效率。坚持以满足重特大突发公共卫生事件应对处置需要为标准，打造医疗防治、物资储备、产能动员一体化保障体系。科学长远规划公共卫生科研体系，与强化生命健康国家战略科技力量紧密结合，提高科技战略储备水平。